Biodiversitäts-Exploratorien - Beechadapt

Genetische und adaptive Variation der Buche (Fagus sylvatica): Welche Faktoren beeinflussen ihre räumlichen Verteilungsmuster?

Ziele:

• Identifizierung von vermutlich anpassungsrelevanten Genen


• Analyse der genetischen Diversität in diesen „Kandidatengenen“ für die anpassungsrelevanten Merkmale Trockenheitsresistenz und Austrieb, da die Exploratorien entlang eines Niederschlags- und Temperaturgradienten liegen


• Untersuchung der Angepasstheit von Buchensämlingen in reziproken Translokationsexperimenten, zur späteren Assoziation von genetischer Variation mit phänotypischen Merkmalen (mögliches Folgeprojekt)

• Wir erwarten eine höhere Differenzierung an adaptiven Genen im Vergleich zu „neutraler“ genetischer Variation.


• Wir erwarten eine bessere Angepasstheit lokaler Sämlinge im Vergleich zu Nachkommen aus anderen Exploratorien.


• Außerdem wird der Einfluss unterschiedlich intensiver Waldbewirtschaftung auf möglicherweise anpassungsrelevante Variation in Kandidatengenen untersucht.

• Transkriptomanalysen mittels Hochdurchsatzsequenzierung sowie die Verwendung von Kandidatengene aus vorangegangener Untersuchungen bei Buche und Eichen (Quercus spp.)


• Analyse ausgewählter SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) innerhalb der Kandidatengene


• Aufnahme phänotypischer Daten wie z.B. Überleben, Austriebsverhalten und Höhenzuwachs

• Müller M, Seifert S, Lübbe T, Leuschner C, Finkeldey R (2017) De novo transcriptome assembly and analysis of differential gene expression in response to drought in European beech. PLOS ONE 12: e0184167. doi: 10.1371/journal.pone.0184167


• Müller M, Seifert S, Finkeldey R (2017) Comparison and confirmation of SNP-bud burst associations in European beech populations in Germany. Tree Genetics and Genomes 13: 59. doi: 10.1007/s11295-017-1145-9


• Müller M*, Seifert* S, Finkeldey R (2015) Identification of SNPs in candidate genes potentially involved in bud burst in European beech (Fagus sylvatica L.). Silvae Genetica 64: 1-20. *equal contribution